LKF är organiserat i två affärsområden Affärsområde Kunskapshus och Affärsområde Offentliga Hus samt stödenheterna Ekonomi/finans, Ledningsstöd, Teknik och Projekt.

Affärsområde Kunskapshus ansvarar för skolor, där ingår förskolor, grundskolor och gymnasieskolor. Affärsområde Offentliga Hus består av förvaltningsområdena sport-special-omsorg. Sport består av allt från mindre idrottshallar till evenemangsarenan Cloetta Center, Special ansvarar för bl. a kulturhus, räddningstjänst och omsorg som förvaltar fastigheter för vårdboende, serviceboende och gruppboende.

Teknikavdelningen samordnar och planerar långsiktigt frågor av teknisk karaktär såsom planerat underhåll, fastighetsskötsel, energieffektivisering, säkerhet och teknisk dokumentation. Projektavdelningen ansvarar för genomförande av investerings- och underhållsprojekt. I projektavdelningen ingår också LKFs byggservicegrupp. Teknikavdelningen och projektavdelningen arbetar utifrån affärsområdenas behov och affärsområdescheferna har ett samordningsansvar mellan AO och projekt och teknik.

I staben finns ekonomi/finansavdelning samt funktioner för personal, miljö, verksamhetsutveckling, IT, upphandling och administration. Samtlig personal på LKF är anställd i moderbolaget. Ledningsgruppen består av 8 medlemmar och representeras av VD, ekonomichef, teknikchef, projektchef, AO-chefer, personalansvarig, samt verksamhetscontroller.